他的曾祖父是前清举人，祖父和父亲都是秀才。黄先生从小聪明过人，四岁入初小，8岁入高小，11岁进南通中学初中部，14岁免试入高中，17岁考入中央大学（现南京大学）化学系，师从我国化学界前辈、著名有机化学家庄长恭先生。庄先生曾留学美国，在德国做客座教授一年，回国后出任中央大学理学院院长，讲授高等有机化学，涉及到许多当代有机化学的前沿领域。黄耀曾因成绩优异，得到庄先生的青睐，1934年黄耀曾大学毕业时，受庄长恭先生之邀，进入中央研究员化学所工作，任助理员。黄耀曾的科研生涯就此揭开了第一页。
微量分析和间谍案
在中央研究员化学所，黄耀曾在庄先生手下做有机微量分析和有机合成。在30年代，有机微量分析是国际上有机化学研究中的先进技术，但在我国尚未开始，当时化学界采用的常量分析，需要100毫克样品，而微量分析只需要3到5克样品。
黄耀曾用庄先生从奥地利带回来的微量分析天平和微量分析仪器，摸索着掌握了有机微量分析操作技术，并分析出贝母素甲的经验式，但与当时我国化学界前辈用常量分析导出的经验式大不相同。新技术受到了质疑。于是，庄长恭将样品寄往德国两家最负盛名的微量分析实验室分析。
半个月后，德国两家微量分析实验室将分析的数据寄回来了，结果和黄耀曾先生做的完全相同，因此改正了贝母生物碱的经验式。从此，有机微量分析技术在我国站稳脚跟，并逐渐传播至国内其他单位。有机化学所的微量分析现在还承接世界各地的样品。而黄耀曾先生无疑是我国有机微量分析方法的创始人。
关于微量分析，还有一段“剖析半张密写纸，破获一个间谍案”的佳话。
那是1958年的某一天，公安部门几位同志来到上海有机化学研究所，告诉党委书记边伯明：最近发现一伙间谍，用密写纸通信联系，这种纸是从国外寄来的，有水印，在紫外光照射下发生荧光。公安部门曾把缴获来的十多张纸，交某单位剖析，结果未得出结论，却把大部分纸给报废了，只剩下了半张。
现在，他们要求上海有机所利用这半张纸作剖析，弄清这是用什么密写液写的，并把密写字迹显现出来。边伯明把这项任务交给了黄耀曾。黄先生用乙醇从这半张纸中提取了3毫克结晶，将其中的1.5毫克做元素微量分析，发现C、H含量甚低，猜测提取物不是一般的有机化合物，而是含有某种重金属的化合物或盐。于是黄先生又用半毫克做发射光谱，果然发现了某一种重金属。
关键找到了！根据这种重金属的特性，很快找到了显色剂，又用它将密写字迹清清楚楚地显示出来！这一发现破获了一个间谍集团。1984年公安部某研究所所长赞扬有机所为破获重大案件作出了杰出贡献，自从密写纸被识破以后，特务们再也不敢在中国使用这种密写纸了。
“西力生”和金霉素
50年代初期，华东地区小麦的黑穗病、棉花的红腐病和立枯病为害剧烈，使农产物减产甚至达50％以上，黄耀曾接受华东农林部委托的任务——剖析和试制有机汞杀菌剂“西力生”。他和王有槐合作研制“西力生”的合成，并且打破前人的框框，制得样品。移交沈阳农药厂生产后，以两万吨规模供应市场，基本上消灭了这些病害。为提高农业产量，做出了贡献。
凡是看过话剧《陈毅市长》的人，无不为陈市长在解放初期为生产青霉素夜访化学家的情节所感动。在剧中那位被访的化学家身上，也有着黄耀曾的影子。他就是在那个时候参加金霉素和四环素药物研制的主要人员之一。
50年代，国际间抗菌素的研究迅速发展，继青霉素之后，金霉素、土霉素、链霉素等相继出现，后几个品种当时就占了抗菌素产值的40％，但它们的生产为英美所垄断，我国只能依赖进口来满足治疗上的需要。为解决依赖进口的状况，黄先生在抗菌素委员会的领导下，承担了金霉素的提取纯化工作。但研制金霉素一无资料，二无菌种，商品广告也只能误导人。
经过无数次的失败，他终于摸清了金霉素对酸、碱的变化，他和几个同事合作改进了金霉素的提取工艺，并在不到半年的时间里，把试制成功的金霉素放到上海第三制药厂进行批量生产。金霉素的研制成功，不仅治愈了许多病人，冲垮了美帝的经济封锁，打破了少数国家的垄断，而且在东南亚市场上，第一次出现了这样的赞美词——“这是中国货的金霉素，顶刮刮！”金霉素工作获得了中国科学院科学奖。
人物百科
黄耀曾（1912.11—2002.12），男，江苏南通人，1934年毕业于国立中央大学化学系。中国科学院上海有机化学研究所研究员，有机化学家，国内有机氟化学及金属有机化学学科的奠基人。早年从事甾体化学研究，在我国开创了有机微量分析方法。从事过金霉素提取、结构测定及全合成的研究。实现第一例催化的胂型维蒂希反应。对砷、锑、碲元素金属有机化合物的反应及其在有机合成中的应用研究，居国际前列。曾获国家级奖励5次和第三世界科学院化学奖，何梁何利基金科学与进步奖。1980年当选为中国科学院学部委员（院士）。
