9月29日上午，论坛开幕式在逸夫楼演讲厅举行，中国工程院院士、副校长钱锋教授出席开幕式并致辞。开幕式由生物工程学院副院长卢艳花教授主持，南京中医药大学副校长谭仁祥教授、中科院南海所张长生教授、华东理工大学生物工程学院张元兴教授、研究生院常务副院长龚学庆教授，以及来自复旦大学、上海交通大学、南京大学、江南大学、南京工业大学、浙江工业大学、湖北工业大学、福建农林大学、上海理工大学、上海中医药大学、上海师范大学、上海海洋大学、苏州科技大学等14所高校的119名研究生，共同出席了开幕式。
致辞中，钱锋首先对支持学术论坛的上海市学位委员会和专家学者表示衷心的感谢，对参加学术论坛的研究生表示热烈的欢迎。他系统介绍了我校发展历史、办学理念、学科布局、人才培养，以及生物工程学科的发展和国际影响。钱锋指出，本次论坛旨在发挥全国第一个生物工程博士授权一级学科对学科发展的引领和辐射作用，扩大院校之间、学科之间、研究生之间的学术交流，共享优质教育资源，促进高层次创新人才脱颖而出。他希望参会研究生能借本次论坛之机，围绕生物工程学科的国际前沿和国民经济建设的重大需求，加强学术交流、开阔学术视野、启迪学术智慧、传承学术精神、激发钻研热情、增强创新意识和创新能力，努力成长为可堪大用、能负重任的栋梁之才。
隆重而简短的开幕式之后，来自生物工程相关领域的专家，谭仁祥教授、姜卫红教授、卢大儒教授、张元兴教授、张长生教授、林厚文教授、冯雁教授、肖意传教授、谭文松教授、张立新教授为参加学术论坛的研究生分别作了题为“诺奖及其趣闻”“微生物代谢调控的解析与重塑”“精准医学与基因检测”“生物工程的未来”“海洋微生物大环多环内酰胺的生物合成与药物发现”“基于海绵共生与化学防御机制的海洋药物研究”“分子酶学：机遇与挑战”“胶质细胞介导中枢神经系统炎症的研究”“细胞与组织工程的现在和未来”“阿维菌素的中国制造”等的共10场精彩的前沿学术报告。
次日，学术论坛还组织与会研究生分2组进行了自由学术交流。由多位本学科领域教授组成的点评专家，评选出获奖论文，并在闭幕式上对获奖研究生进行了表彰。
2016年上海“生物工程创造美好未来”研究生学术论坛，为上海乃至全国的生物工程及相关学科的研究生提供了一个高起点、多领域、大范围的学术交流平台，对研究生科学创新研究意识的培养和能力的提高起到了重要的促进作用，实现了学术论坛帮助研究生了解学术前沿、开拓视野、增强创新意识、提高创新能力和学术交流能力的举办目标，进一步提升了我校生物工程一级学科的影响力
