普遍而言妈妈们或多或少都听过母乳的好处，专家通常建议新生儿在出生后一小时即可开始哺喂母乳，因为对宝宝来说，母乳不但易消化、好吸收，里头更含有成长所需的营养，像是蛋白质与脂肪、维生素、胡萝卜素、各种微量元素及益生菌等，对于提升宝宝的抵抗力，促进脑部发育都有相当程度的帮助。
其中母乳所含的醣类除乳糖为主成份，更是囊括丰富且种类繁多的寡糖(HMOs, Human milk oligosaccharides)。一提到寡糖则不免让人直接联想到益生菌的食物来源，母乳里每毫升含有数千至数十万的细菌不等，种类多达千种，其中就属双歧杆菌和乳酸杆菌两类对人体健康至为重要，分别各占近0.5-1.0%。统计指出，据宝宝一天摄取约800毫升以上的乳汁来说，相当于吃下至少100万只的益生菌。
母乳存在的菌种具有促进婴儿免疫系统成熟的能力，婴儿肠道中约70-80%是由母亲菌种所转移的，且母乳宝宝体内双歧杆菌与乳酸杆菌最终可达结肠菌的90%以上，更是提高人体免疫力的重要因素。
母乳菌－母亲送给孩子最好的礼物
从上述信息让我们了解到「母乳并不是无菌的」，那么这些菌又是打哪来的呢？除妈妈皮肤本身就有细菌依附其上，乳腺所含细菌（或益生菌）来源的相关描述从2003年直至近期持续都有科研文献提及。
早期的学者认为，母乳中的细菌是来自于宝宝口腔回流所构成，这些细菌藉由宝宝的吮吸再回到妈妈的乳腺导管。
在2008-2010年，科学家从母乳乳汁中检测到了厌氧菌（如双歧杆菌、乳酸杆菌），并确认这些细菌无法单纯藉由外源途径获得，必定存在某种内生途径进入到妈妈的乳汁中。
最后2012-2014更加确认，当孕妇来到怀孕期的中后阶段，免疫树突细胞会在肠道中伸出特有的触手从母体众多肠道菌进行筛选与攫取，这群经过千挑万选中胜出的菌种则被携往血液中并进入淋巴循环，再转移至乳腺后形成了母乳菌，此种机制则被命名为肠-乳通路(entero-mammary pathway)的菌丛转移途径。但为何选在乳腺将其释出，部份学者提出是为了预防哺乳期乳腺炎的发生，降低乳汁堵塞以更好地喂养宝宝们。
由于母亲体质与母乳之间存在联动性，专家通常会建议妈妈尽可能地按时补充足量的益生菌，再以母乳喂养方式将这些功能良好的菌种供予给宝宝们以发挥作用，确实有其道理。
母乳菌的研究趋势及应用
近期母乳益生菌着重在探讨具备哪些乳酸菌特有的保健功能，最常见就是抑制致病菌，主要落在肠道致病菌。实验结果可有效抑制志贺氏菌(Shigella)、沙门氏菌(Salmonella enterica)、李斯特菌(Listeria monocytogenese)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)与大肠杆菌(Escherichia coli)等食品安全的重点致病菌。也有研究指出母乳菌可减少肠漏与肠通透管控的问题，强化肠道屏障、防止致病菌入侵，并干扰大分子食物过敏原的刺激。目前肠道保健的功效确认已过临床，可作为改善腹泻、治疗肠绞痛、缓解肠躁症等疾病的替代施行方案，同时具有降低呼吸道感染的预防效果。
除肠道保健之外，以减脂瘦身为例，筛选自母乳的短双歧杆菌(Bifidobacterium breve)、动物双歧杆菌乳亚种(Bifidobacterium animalis ssp. lactis)、鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)，小型临床试验显示具有控制体重也降低身体质量指数(Body Mass Index, BMI)的功效。
在女性私密保健功效上，从母乳中获得的菌种像是短双歧杆菌(B. breve)、长双歧杆菌婴儿亚种(Bifidobacterium longum ssp. infantis)、动物双歧杆菌乳亚种(B. lactis)、鼠李糖乳杆菌(L. rhamnosus)等，对主要致病菌如白色念珠菌(Candida albicans)、克雷白氏菌(Klebsiella pneumonia)具有显著的抑制效果。
另外抗过敏或免疫力提升这类免疫调节的相关功能，则证实可刺激树突细胞与外围免疫血球增加伽玛干扰素(IFN-γ)、介白素-10及介白素-12(IL-10, IL-12p70)的分泌，平衡第一型辅助型T细胞与第二型辅助型T细胞(Th1/Th2)两者间的免疫反应，达到缓解过敏效果的菌种，验证有长双歧杆菌婴儿亚种(B. infantis)、鼠李糖乳杆菌(L. rhamnosus)与格氏乳杆菌(Lactobacillus gasseri)等菌种。
近期更多研究文献在探讨产后妇女乳腺炎发生情形，治疗方案与使用母乳菌的直接关联。与老化相关的像是抗氧化及氧化还原功效，可去除金属离子与降低自由基的产生，提高抗氧化酵素(过氧化氢酶、超氧化物歧化酶)活性，及活化细胞抗氧化效率。而早产儿的坏死性肠炎(necrotizing enterocolitis, NEC)预防与治疗、降低代谢疾病发生、抗癌预防等易引发高度关注的功能同样是近几年开发的重点项目。从以上种种功能性研究，证实母乳菌不只局限使用在婴幼儿，确实有许多成人或特殊需求的潜在保健功效等待发掘。
