根据招股书披露，三元生物的董事会秘书魏忠勇在2020年6月才任职于公司，此时距离三元生物首次申报上市并发布招股书（申报稿）仅提前了半年时间，在此之前，魏忠勇在北京连山科技股份有限公司担任审计经理职务。
2021年4月10日，上交所披露6份监管决定书，本次监管处罚措施涉及四家科创板申报企业，其中就包括北京连山科技股份有限公司及签字律师、会计师等，处罚内容主要存在保荐代表人核查工作不审慎、执业不规范导致的履职尽责不到位等问题，最终该公司的IPO申请被终止。
针对连山科技，监管部门发现的问题包括：除保留发货申请单外，无发货记录、客户沟通记录、软件刻录记录、软件维护记录、售后记录、序列号管控清单等内部业务资料；2016年确认收入的验收单主要系后补;部分发货申请单中列示的序列号数量与合同约定的软件销售数量无法匹配；与该客户签订的合同上对方签章名称为“青山市新业房地产开发有限公司”，与客户实际名称不一致，发行人在合同管理中对此未予关注；实际控制人替发行人代垫业务费用等问题。
值得关注的是，上述财务管理不合规现象，正发生在魏忠勇在担任连山科技审计经理期间。
再来看三元生物的经营数据，根据招股书披露，三元生物的核心产品为赤藓糖醇，在2018年到2020年期间产能产量都出现了较大增幅，2020年的产量为4.89万吨，相比2018年的1.94万吨增幅不到150%。
而与此同时，三元生物的能源消耗增幅却非常高，耗电量从2018年的1579万度增长到2020年的7522万度，2020年耗电量相当于2018年5倍；蒸汽耗用量方面，2020年采购蒸汽3174.23万元，而在2018年则没有蒸汽采购。这也就意味着，三元生物在2019年和2020年期间的能源消耗数量增幅，远远大于同期产品产量增幅，2020年单位赤藓糖醇产品对应的能源消耗量，几乎是2018年的两倍。在碳中和的大政策背景下，三元生物为什么会出现单位产品能耗大幅增加的现象？对此，该公司并未接受记者采访。
不仅如此，在招股书中三元生物还描述到：“公司赤藓糖醇生产工艺、能耗管理、成本控制等均具备较强竞争力”，公司所拥有的一项实用新型专利“一种可处理高浓度料液的离子交换装置”，其技术特征就包含“提高离子交换可处理料液浓度，降低能耗成本”，这与2019年、2020年单位产品能耗大幅增加的实际数据存在矛盾。
另据招股书披露，“山东欣诺辰生物科技有限公司”是三元生物2020年度第4大客户，对应销售金额高达4657.65万元，该客户注册成立于2019年3月，专业从事食品添加剂、饲料添加剂的贸易，但据《全国企业信用信息公示系统》查询显示，截止到2020年末该公司的实缴资本为零、员工社保缴纳记录仅为2人，该客户的经营体量是否能够与将近五千万元的采购额相匹配，是值得拷问的。
此外，根据招股书披露，三元生物2020年的拥有37名研发人员，占员工总数的比例为13.70%，而与此同时，招股书披露研发费用中包含的人力成本支出，在2020年仅为322.87万元，这就对应着三元生物的研发人员人均人力成本仅为8.73万元、月均仅为7000元左右，而且这还是包含了由企业承担的社保、公积金等成本，显著低于同年三元生物销售人员、管理人员的人均薪酬水平。
