睿鹰制药集团在污水处理设施上先后投资了7000余万元，建有日处理能力5000立方米的污水处理厂，采用多级生化处理工艺。生化处理污水系统中培养驯化的活性微生物，在生化系统中不断更新换代，老化一代，新生一代，这些老化的微生物经沉淀池沉淀后，由压泥机将其压出，其干物质的蛋白含量达到45%以上，然后送往有机肥料厂进行加工处理。
"企业人眼里不应该有废物，废物是放错了地方的资源。"睿鹰制药集团总裁彭继先如是说。随着全球能源日趋紧张，能源价格越来越高，一个企业在节能减排上的力度和成效，直接决定着企业的成本和市场竞争。企业开展节能减排工作，既符合国家的发展方向，又利于企业降低成本，增强市场竞争力。该公司在做好环保工作的同时，把生产中的废水、废气、废渣全部变成了可利用的资源，起到了节能减排的双重效果。
为减少废水排放的环境污染和资源浪费，实施真正意义上的节能减排，该公司投资2000余万元成功开发上马了反渗透中水回用工程。在利用目前生化处理后的外排水基础上，再经过粗滤、微滤、超滤和反渗透，最终处理后的水质好于地下深井水，可以替代锅炉用水和生产工艺用水。目前一期膜处理工程于2008年9月安装完毕并投入运行，处理能力1500立方米/天。由于运行效果很好，公司针对污水处理中心的现状又投入巨资上马了二期膜处理工程，处理能力达到4000立方米/天，可实现中水回用率70%以上。
在污水处理的过程中，该公司把生化处理废水所产生的沼气进行封闭收集，并通过管道进入燃烧系统，使其替代了原煤的使用。仅此一项，每年可为公司减少使用原煤3000吨，为企业节约资源成本240余万元。既避免了锅炉燃煤废气对空气的污染，又节约了能源。
公司EHS总监李爱国认为："如今，企业之间的竞争已经从产品、人才、市场的竞争，逐渐演变成为企业自身解决资源和环境能力的竞争，即资源成本的竞争。通过运行利用生产‘三废’循环经济模式，使睿鹰在市场上具有了更大的竞争力和发展潜力，同时也达到了节约资源、降低成本、稳定市场的多重深远意义。"
