国家863计划现代农业技术领域针对口蹄疫、禽流感、猪瘟等重大动物疫病，研制开发了高效疫苗40种，一批新兽药已进入临床应用和试验阶段，将为我国动物重要疫病防控、保障食品安全和社会公共安全提供产品支持。
在畜禽重要病毒病、细菌病、寄生虫的基因工程疫苗的构建和研制上取得重大突破：研制了针对口蹄疫、禽流感、狂犬病、猪瘟等畜、禽重大病毒病的单价和多价基因工程疫苗10种；创制了针对猪链球菌、猪肺炎支原体、鸡白痢、鸡伤寒沙门氏菌和禽大肠杆菌病等基因工程疫苗等9种；研制针对血吸虫、猪囊虫、鸡球虫、羊泰勒虫等畜禽重要寄生虫病的基因工程疫苗15种。这些新疫苗中已有5个进入临床试验阶段。
在新型生物兽药研究上，以抗病毒、抗细菌、抗寄生虫为主要目标，研制了一批广谱、高效、低残留的新型兽药并进入临床试验阶段。构建了高产多拉菌素bkd基因缺失突变株、高产假黑盘菌素的转基因毕赤酵母、高效表达抗菌肽的大肠杆菌、高产南昌霉素与梅岭霉素的基因定点突变菌株、表达人防御素NHP4基因的大肠杆菌和毕赤酵母菌株等基因工程菌近30株，建立了细菌素、沃尼妙林、托拉菌素、泰乐菌素等新兽药的发酵和制备工艺。改进了托拉菌素原药生产的制备工艺，使总收率提高到30.8%，比美国专利报道的15％提高了一倍，大幅度降低了生产成本。
