20世纪80年代后期，以基因工程为代表的高新技术的迅速崛起，为生物化工的进一步发展开辟了新的领域，它将为解决人类所面临的资源、能源和环境等重大问题起到积极的作用。目前已有部分国家成立了专门的研究组织并制订了该产业发展的中长期规划，在国家相关政策以及资金等方面都给予了大力支持，使得生物化工产业发展潜力巨大。
近些年来，我国生物化工产业发展迅猛。有机酸中柠檬酸工艺和技术都已位居世界前列；乳酸，氨基酸中，赖氨酸和谷氨酸生产工艺和产量在世界上都占有一定的优势；微生物法生产丙烯酰胺已实现了工业化生产；甘油发酵水平也在不断提高；微生物法生产丙烯酰胺、已二酸、透明质酸、天门冬氨酸等产品的生产已具有一定的工业生产规模；纤维素制乙醇技术已开始应用；生物法生产高性能高分子、高性能膜、高性能液晶、生物可降解塑料等技术也在不断完善等。
尚普咨询化工行业分析师认为，当前的首要任务是要加大对生物高技术医药产品、农业及天然生物工程产品、及可再生资源生物加工工艺、动植物细胞培养的工艺与工程的开发力度。另外，在产业化方面，要充分利用现代生物化工技术改造现有及传统生化产品的生产工艺及设备，加速走向现代化步伐;大力发展氨基酸工程、蛋白质工程等技术，为改变我国现有食品结构，解决未来粮食缺乏的局面做出应有的贡献；利用现代生物化工技术，大力开发众多的精细生物化工产品，如生物色素、甜味剂、酶制剂；深入开展生物催化剂和生物转化的酶工程研究，其反应过程比起传统的化工过程具有不可比拟的优越性；开展新型生化分离方法和工程研究，包括新型高效分离设备、分离介质以及新的分离工艺和流程的研制开发。
由于生物化工产业的发展与传统化工相比优势明显，目前国家对生物化工产业的发展十分重视，尤其是在生物化工技术方面，如生物技术下游国家重点实验室和国家生物化工研究开发中心的建设等，为我国生物化工产业提供了较好的技术支持。
尚普咨询分析师认为，目前生物化工产业出现了一些新的发展趋势：一、工业结构方面，行业与行业间的划分将日趋模糊，企业间的合作将加大；二、产品结构方面，生物化工产品正向专业化、高科技、高附加值方向发展；三、技术水平方面，不断提高菌株活力、发酵水平、生化反应过程、分离纯化水平，依然是目前生物化工面临的课题。
生物化工在工业技术进步和产业调整等方面的发展起着非常关键的作用。生物化工的发展将有力地推动生物技术和化工生产技术的变革和进步，产生巨大的经济效益和社会效益。未来20%-30%的化学工艺过程将会被生物技术过程所代替，生物技术产业将成为重要的化工产业。今后，随着国内生物技术水平的提高以及相关技术产业化进程的加快，我国生物化工产业或将迎来一个崭新的发展时期。
