恒瑞药业潜心创新药的研发，大力组织实施以瞄准国际新药研究前沿的best-in-class研发模式进行新药研发，紧跟国际领先制药企业研发动态，实现医药产品结构从仿制为主到自主创新为主的战略性转变。
人体由肝脏产生的七因子酶原经激活形成激活七因子，该凝血因子可以治疗先天性血友病，还可满足外科止血和器官移植等不同的临床需求。由于七因子在正常人血液中的含量很低并且处于非激活状态，因此，用重组DNA技术进行七因子的生产成为一个经济有效的途径。目前为止，国内还没有自主研发的同类型产品上市。世界上仅有英国、加拿大等少数几个实验室进行了七因子重组DNA技术的表达和纯化研究。恒瑞公司目前引进顶尖科学家团队，正向这一顶尖课题展开攻关。这个研究团队在北美生物技术公司已经从事生物药的研发二十多年，恒瑞目前的研发已经瞄准国际最前沿。
恒瑞药业是国内A股市值最高的企业之一，多年来潜心创新的研发及产业化。在连云港已新建了一个22000平方米的研究和检测的科研大楼，有2400平方米符合国家GMP要求的中试放大车间，先后承担了11项国家“重大新药创制”科技重大专项研究课题，3项863计划项目、9项国家火炬计划项目、7项国家星火计划项目和几十个国家、省级科技攻关项目。目前已有118项产品技术申请了国家发明专利，已授权28项；37项产品技术申请了国际发明专利，已获美国专利授权4项。公司目前在研项目50余项，进入临床研究的品种20余个，开发的候选化合物20余个，其中正在临床的拥有自主知识产权的国家1.1类新药研究10多项。
