国税总局表示，根据现行增值税政策规定，玉米胚芽属于《农业产品征税范围注释》中初级农产品(11.98,0.22,1.87%)的范围，适用13%的增值税税率;玉米浆、玉米皮、玉米纤维和玉米蛋白粉不属于初级农产品，也不属于《财政部国家税务总局关于饲料产品免征增值税问题的通知》(财税[2001]121号)中免税饲料的范围，适用17%的增值税税率。
该次调税自2012年5月1日起施行。这是玉米价格不断“高烧”后，国家再次出台政策提高玉米深加工企业适用增值税税率。
在此之前，国家已经对玉米深加工收紧控制。2011年5月11日，财政部国家税务总局下发财税([2011]34号)文，明确要求：为控制玉米深加工过快发展，经国务院批准，暂停玉米深加工企业收购玉米增值税抵扣政策。自2011年4月20日起至6月30日，纳税人向农业生产者购进玉米深加工生产除饲料产品之外的货物，不得开具农产品收购发票并计提进项税额。
该政策的关键是，将之前实施的深加工企业收购玉米的可抵扣13个点进项税取消了。
目前，华北、东北玉米价格为2260元/吨左右，而在南方消费区价格达到2600元/吨。东方艾格大宗农产品分析师马文峰表示，现在玉米价格高企，“主要是国际市场在热炒中国需求，事实上，2011年全球玉米增长7%-8%，国内玉米产量增长约10%”。
去年以来，国内玉米供需偏紧的矛盾凸显，玉米涨价预期日趋强烈。在国内通胀预期日趋严峻的大背景下，新一轮玉米涨价潮再度到来。从去年底到今年初，国家发改委、国家粮食局等部门联合调查组就先后两次深入东北玉米主产区调查玉米市场情况，得出结论是，深加工企业是去年以来国内玉米价格大幅上涨的推手。
与其他粮食不同，玉米加工链条很长，容易促发价格链反应。玉米深加工包括酒精、淀粉、味精、果糖、柠檬酸以及燃料乙醇等。而玉米深加工用粮增长惊人，2008年玉米深加工用量 3500万吨，到了2010年已达到5000万吨，两年净增1500万吨的需求。其中燃料乙醇每年产能150万吨，需用玉米500万吨。由于需求量大，玉米深加工企业抬价收购，以争取更多粮源。
为控制玉米深加工过快发展，国家出台了一系列政策，严格限定玉米深加工企业玉米采购量。但实际的情况是，玉米深加工企业仍在不断扩张。
同时，国家也对玉米生物能源加紧了控制，并调低补贴。中粮生化(000930.SZ)4月17日公告称，公司近日收到财政部《关于调整生物燃料乙醇财政补助政策的通知》，经国务院批准，中央财政决定调整生物燃料乙醇财政补助政策，2012年度生物燃料乙醇财政补助标准如下：以粮食为原料的燃料乙醇，补助标准为500元/吨;以木薯等非粮作物为原料的燃料乙醇，补助标准为750元/吨。
依据财政部规定，中粮生化2012年度以玉米为原料的燃料乙醇补助标准较2011年平均每吨减少了776元。
