1.1.5植物抗菌肽 植物中也存在一些结构上与昆虫、哺乳动物防御素结构相似的植物抗菌肽，称为植物防御素。大多数植物抗菌肽对植物病原具有良好活性，部分植物抗菌肽对革兰氏阳性菌、阴性菌，真菌，酵母及哺乳动物细胞均有毒性。Thionins是最早从植物中分离的抗菌肽，新近的研究表明小麦Thionins具有很好的杀利什曼原虫活性[15]。
1.1.6细菌抗菌肽细菌抗菌肽又称细菌素（bacteriocin），包括阳离子肽和中性肽，革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌均可分泌。细菌中已发现的抗菌肽有杆菌肽(Bacitracin)、短杆菌肽S(Gramicidin S)、多粘菌素E(Polymyxin E)和乳链菌肽(Nisin)4种类型。目前，APD数据库中就收录的细菌素有119种，其中乳酸链球菌肽nisin是由乳球菌产生的含3～4个氨基酸残基的短肽，它是一种耐酸性物质，即使在胃这样低pH环境中稳定性也很高，能抑制革兰氏阳性菌如梭状芽孢杆菌和李氏杆菌。Bacillus spp.产生的杆菌肽mersacidin对“超级耐药菌”--耐甲氧西林葡萄球菌（MRSA）具有良好的抑制作用，通过腹腔给药可以清除MRSA感染小鼠血液、肺、肝、肾、脾等脏器中的细菌，并且对小鼠各器官没有造成明显的损害[16]。
1.2抗菌肽的理化特性与结构分类
抗菌肽一般具有以下理化特性：（1）一般由10～50 个氨基酸组成，分子量小，热稳定性好，免疫原性低；（2）富含疏水和碱性氨基酸残基，所以大多数抗菌肽都带正电荷且具有两亲性；（3）抗菌肽在较大的离子强度和较低或较高的pH值下仍可保持较强的活性；（4）部分抗菌肽还有抵抗胰蛋白酶和胃蛋白酶水解的能力。
不同来源、不同结构的抗菌肽的一级结构具有较强的保守性，且N 端富含极性氨基酸，绝大多数抗菌肽的第二位氨基酸残基是Trp，C 端通常酰胺化，分子中间富含Pro，这些特征对抗菌肽广谱的杀菌活性的高低起着至关重要的作用，甚至直接影响抗菌肽的杀菌活性。
根据其化学组成，高级结构以及其功能进行分类可将抗菌肽分为5类: (1) α-螺旋结构类，如天蚕素（Cecropins），蛙皮素（Magainins）等；(2)β-折叠型，该类抗菌肽是在分子内有两个或两个以上二硫键，动物防御素多数属此类结构，如绿蝇防御素分子内有6个半胱氨酸形成3个分子内二硫键，肽链C末段是带有拟β转角的反向平行的β片层；(3) 伸展性螺旋结构类，该类抗菌肽不含半胱氨酸，但富含脯氨酸和精氨酸或色氨酸残基，如从蜜蜂体内分离到的apidaecins中脯氨酸和精氨酸的含量分别高达33% 和17 %，通常由15～34个氨基酸残基组成在两亲性分子内部形成分子内α-螺旋； (4) 环链结构类，该类抗菌肽在C末端有一个分子内二硫键，在C末端形成一个环链结构，而N末端为线状结构，如青蛙皮肤细胞产生的brevinins和bactenecin均属于此类；(5)由其他已知功能较大的多肽衍生而来的具有抗菌活力的肽[1]。
