由中国菌物学会与中科院微生物所真菌学国家重点实验室创新性研究平台中心联合举办的“真菌组学生物信息分析”培训班,于4月20日至25日在中科院微生物研究所举办。来自全国科研院所院校的60余名学员参加了本次培训,同时培训课程也作为中科院微生物所博士专业课程对博士生开放选修,40名来自各院所的博士生同学选修了本课程。
培训班邀请了活跃于真菌基因组学和真菌生物信息学研究领域三位专家:中国科学院上海植物生理生态研究所王成树研究员,中国科学院微生物研究所刘杏忠和白逢彦研究员作为主题报告人,从真菌基因组的比较与研究,真菌组学研究的策略和经验,真菌群体基因组学研究等方面,对真菌基因组学近年来的热点方向和关键科学问题进行了讲解与介绍。在之后的4天半的时间里,创新性研究平台中心团队的各位老师,在专题讲授的基础上以计算机实际操作为主,通过实例为基础向学员们讲授了拟测基因组真菌选择,基因组测序策略制定、基因组组装、共性分析、个性化分析等流程以及生物学与组学数据融合和论文设计等内容。在课程最后,邀请了通过创新性研究平台分析过真菌基因组和转录组数据,并发表了高质量论文的青年研究人员分享自己在真菌组学方面的经验、成绩、问题和设想,与参加学员互动交流。通过历时5天的培训活动,学员对真菌基因组学和真菌生物信息学的从宏观蓝图到具体操作有了一定的接触与理解,时间虽然有限但受益匪浅。中科院微生物所对本次培训活动给予了高度支持和大力帮助,副所长东秀珠研究员在培训开幕式致辞中提到,生物信息学这门随着基因组学的发展而诞生的新学科,是帮助我们认知和阐释基因组的关键学科。培训班的举行正是为大家走进生物信息学提供了宝贵机会,望各位学员能有所收获。
作为中国科协下属的全国一级学会,组织和开展继续教育和培训活动一直是中国菌物学会的学术交流重点工作之一,目的正是为科研一线的老师同学提供迫切需求的培训活动。新一代测序(Next Generation Sequencing,NGS)技术的效率提升和价格平民化,有力推动了真菌基因组测序及其相关研究,国内也大量涌现真菌各种组学测序并产生了海量数据。然而大多数公司主要致力于测序,对海量的数据只做常规分析,难以满足不同研究者的个性需求。尽管国内已对100多种真菌进行了基因组或转录组测序,但发表的组学文章依然很少。近年来随着国内外大量真菌组学研究的开展,这方面的文章将愈来愈难以发表。本次培训与真菌学国家重点实验室创新性研究平台中心共同举办,借助平台在真菌基因组学分析技术方面的经验和师资力量,从实践和理论相结合的角度出发,为广大学员解决生物信息学分析方面遇到的实际问题和困境提供帮助和支持。未来学会将继续与真菌学国家重点实验室创新性研究平台中心合作,针对本学科的科研技术需求开展更多类似的培训活动。
活动现场