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【技术帖】一篇带你玩转KEGG数据库注释

   日期:2023-02-09     来源:kegg    浏览:589    评论:0    
核心提示:截止2018.4.12kegg数据库总共包含:525个代谢通路(Pathway maps),21,952条同源群(KEGG Orthology (KO) groups),涉及物种442真核生物、4654细菌,268古细菌和317种病毒。涉及到基因数目26,161,327条。
  
 1.home网址:http://www.kegg.jp/kegg/

2.关于kegg数据库的一些统计情况:http://www.kegg.jp/kegg/docs/statistics.html截止2018.4.12该数据库总共包含:525个代谢通路(Pathway maps),21,952条同源群(KEGG Orthology (KO) groups),涉及物种442真核生物、4654细菌,268古细菌和317种病毒。涉及到基因数目26,161,327条。

3.区分map00010、ko00010、hsa00010

 

map:参考参考代谢通路图(图1),

ko:高亮过KOs的参考代谢通路图(图2紫色表示)

单属于人的代谢通路图以绿色标注出(图3绿色)

图 1代谢通路图map00010

图 2高亮KO后的map00010

图 3 人的map00010

4. 特殊的代谢通路以及备注

 
     
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